Come qualsiasi altra forma di testosterone, Sustanon 250 online viene convertito in estrogeno. Per questo motivo Sustanon provoca effetti collaterali come ginecomastia, edema, deposizione di grasso di tipo femminile e soppressione della produzione del proprio testosterone. Questi effetti collaterali possono essere prevenuti utilizzando antiestrogeni come Nolvadex o Clomid.
Come risultato di una diminuzione della produzione di testosterone endogeno, è possibile sviluppare un effetto collaterale così grave di Sustanon come l'atrofia testicolare. Questo effetto collaterale può essere prevenuto saltando Sustanon per più di 8 settimane e assumendo antiestrogeni. I corsi più lunghi richiedono l'uso della gonadotropina.
Nel corpo, il testosterone viene convertito in diidrotestosterone, che provoca i seguenti effetti collaterali: ipertrofia prostatica, calvizie, acne e altri. Questi sono i cosiddetti effetti collaterali androgeni di Sustanon.
Inoltre, gli atleti spesso segnalano febbre e condizioni simil-influenzali durante il ciclo di Sustanon. Come la maggior parte degli steroidi, Sustanon aumenta il livello di colesterolo cattivo nel sangue (prevenuto assumendo Omega-3 durante il corso).
Dopo l'iniezione, a volte si formano infiltrati (grumi o "protuberanze" nella regione glutea o in un altro sito di iniezione). Di norma, gli infiltrati si risolvono in 2-5 settimane.